Las comisiones dependen del Comité Ejecutivo Nacional y cumplen funciones de orientación, asesoramiento y emisión de dictámenes.
Comisiones establecidas
- Asuntos Nacionales e Internacionales.
- Asuntos Universitarios.
- Problemática Reivindicativa.
- Asuntos Orgánicos.
- Procesos Disciplinarios.
- Presupuesto, Fiscalización y Transparencia.
- Defensa de los Derechos Humanos.
El Estatuto también contempla comisiones especiales y técnicas para temas específicos.